Temporada
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- Temporada 2 2006-09-10
- Temporada 1 2005-11-13
Episodio
- Episodio 1: Médium
- Episodio 2: El pantano maldito, un misterio sin resolver
- Episodio 3: Los oscuros secretos de la Corona Británica
- Episodio 4: Los misterios del pueblo muerto de España
- Episodio 5: La inteligencia artificial
- Episodio 6: La voz de las sombras
- Episodio 7: Viajes astrales
- Episodio 8: Especial Halloween
- Episodio 9: Una explosión de extrañas criaturas
- Episodio 10: La amenaza que viene del espacio
- Episodio 11: Ovnis sobre el mundo
- Episodio 12: Las emociones humanas que viven en lugares
- Episodio 13: Algo ocurre en el sol
- Episodio 14: El caso de Marianne Bachmeier
- Episodio 15: La impactante historia de 'Mataviejas'
- Episodio 16: Los misterios de Nefertiti
- Episodio 17: El gigante de Mozambique
- Episodio 18: Investigación de extraños fenómenos en Mérida
- Episodio 19: Toledo, la ciudad más mágica del mundo
- Episodio 20: Los misterios del cerebro infantil
- Episodio 21: El órgano encantado de Maese Pérez
- Episodio 22: Todo sobre la muerte de 'El mataviejas' en prisión
- Episodio 23: El teatro de Almagro
- Episodio 24: El misterio de la muerte de ocho periodistas
- Episodio 25: Inteligencia artificial
- Episodio 26: Carlo Acutis, el niño milagro de Italia
- Episodio 27: Las sombras del edificio Windsor
- Episodio 28: El misterioso caso de Amityville
- Episodio 29: La última foto
- Episodio 30: El testigo número uno del caso Arny
- Episodio 31: La gran nave nodriza que nos vigila desde el espacio
- Episodio 32: La batalla del Ebro
- Episodio 33: La importancia del sueño
- Episodio 34: Los espectáculos con personajes diferentes
- Episodio 35: Las caras de Tartessos
- Episodio 36: Psicofonías
- Episodio 37: Encuentro en el monte Gorbea
- Episodio 38: La dark social
- Episodio 39: Nuevas psicofonías
- Episodio 40: Crimen en la Transmediterránea
- Episodio 41: Costa Brava, nazis y una posible guerra nuclear
- Episodio 42: Viaje a las ruinas de Xibalbá
- Episodio 43: La increíble historia de los niños de la selva de Colombia
- Episodio 44: Los saqueos de tumbas en Iberoamérica
Cuarto milenio Temporada 18 El órgano encantado de Maese Pérez
Cuarto Milenio trata sobre cualquier tema relacionado con el mundo del misterio y lo desconocido, entre los que destacan: conspiración, ocultismo, criminología, astronomía, ufología, psicología, parapsicología, demonología, arqueología, historia, zoología o física. El programa cuenta habitualmente con la participación de científicos y expertos en diversas materias como psiquiatras, físicos, historiadores, antropólogos, criminólogos, astrónomos, naturalistas, escritores o periodistas. Dirigido y presentado por los periodistas Iker Jiménez y Carmen Porter.
